さくらインターネットは2006年7月にJIPDECよりプライバシーマークの認証を取得し、個人情報保護に取り組んでいます。
そのほか、全事業所およびデータセンターを対象にISO27001認証を取得し、継続的に情報セキュリティ管理を行っています。